细胞反应器是某种细胞的培养生长代谢过程的反应器，这个过程需要控制的条件比较多，比较复杂。
细胞反应器根据工作方式和功能的分类：
一、平面２Ｄ培养（培养皿、方瓶、滚瓶）：
优点：成本低，利于种子细胞制备，前期条件摸索；
缺点： １.培养数量少，规模扩大需要增加平面面积；
２.批次培养质量不可控，产物回收检测手段有限；
３.培养基使用量较大；
４.５０个单位以上处理人力已非常吃力，人力成本较高；
５.配套基础设备数量同步上升（如二氧化碳培养下等）；
二、搅拌式培养（搅拌器）：
优点：技术成熟，专门用于细胞壁较厚的微生物培养或悬浮型培养体系；
缺点：
1.剪切力较大，放大后剪切力剧烈上升，贴壁细胞容易脱落死亡；
2.放大后培养基消耗较大；
3.占地面积较大，操作复杂；
4.容易产生气泡，不利于培养体系稳定；
三、微载体培养（固体床、摇摆式）：
优点：细胞附着程度大于搅拌器式，贴壁细胞培养效果明显上升；
缺点：
1.贴壁细胞面临的剪切力问题没有得到彻底改变；
2.相较于平面培养稍微改善，但溶氧量还是受到限制（固体床尤为明显，溶氧量存在纵向和横向梯度）；
3.微载体与细胞分离困难，细胞聚团现象严重；
4.放大效果较差
四、潮汐式（呼吸式）培养：
1.贴壁细胞；
2.3D培养；
3.0.5升到5000L的线性放大；
4.极高的细胞密度；
5.成本最低的：细胞被固定在专用非微型载体中，细胞收获或产物收获分离更容易；
6.双向供氧方式：达到极限供氧状态；
7.零剪切力、无泡沫：缓慢的液面上下移动；
8.3个月以上连续培养；
