BioNano系统，让基因拼接如虎添翼

时间：2013年4月18日 来源：晶能生物

第二代测序的出现实现了低成本高通量的基因组测序，但是100bp左右的短读长却严重限制了基因组的完整拼接。尤其是当遇到长片段的重复序列时，传统的contig组装和De novo拼接只能面对缺口望洋兴叹。为了掌握直观而全面的基因组结构信息，挖掘出其中的生物学奥秘，科学家们迫切期盼着一种简化基因组拼接的新技术。

BioNano公司站在了基因组拼接的最前线。他们推出了Irys系统用于长链DNA的单分子成像。该系统利用单酶酶切和荧光标记对长达几百kb的单链DNA分子进行成像，利用高质量图像使基因组结构通过酶切图谱的方式展现无遗。Irys特有的超长序列读长能够轻松跨越重复片段和一些包含复杂元件的区域，在大大简化基因组组装的同时也让困扰NGS技术的拼接缺口无处遁形。

已有文章利用该技术快速将节节麦的2.1M高重复区域的组装完整性由75%提升至95%，技术平台操作的简便性和结果的准确性力证了Irys技术的广阔应用前景。BioNano单分子成像技术无疑为全基因组结构研究，尤其是De novo和染色体结构变异方面提供了全新的研究方法。

作为BioNano在中国唯一的服务商，晶能生物技术有限公司致力于为广大客户提供最为**和完善的生物技术服务。日前，晶能生物已经配备了国内首套BioNano系统，并同时推出了BioNano单分子测序服务。凭借晶能生物雄厚的科研力量和完善的服务体系，相信该服务的推出必将为国内生物技术服务行业的发展注入新的活力。

（文：林泓）

参考文献：

1. Das SK, Austin MD, Akana MC, et al. Single molecule linear analysis of DNA in nano-channel labeled with sequence specific fluorescent probes. Nucleic Acids Res 2010;38:e177.

2. Lam ET, Hastie A, Lin C, et al. Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Nat Biotechnol 2012;30:771-776.

3. Hastie AR, Dong L, Smith A, et al. Rapid genome mapping in nanochannel arrays for highly complete and accurate de novo sequence assembly of the complex Aegilops tauschii genome. PLoS One 2013;8:e55864.