控制模式（CV）：呼吸机完全替代实验动物的呼吸，其呼吸频率，潮气量均由呼吸机控制，属于完全的呼吸支持。适用于自主呼吸消失或很微弱的情况，比较典型的应用，就是动物的开胸手术实验。 根据控制参数的不同，控制通气又可以分为容量控制通气(VCV）和压力控制通气(PCV)。容量控制通气(VCV）是呼吸机按预置的潮气量、呼吸频率、呼吸比等参数完成通气。 压力控制通气(PCV)则是呼吸机按照预置的频率、呼吸比、吸气压力工作。

辅助通气（AV）: 呼吸机的送气是通过呼吸机检测实验动物的气道压的降低来触发。辅助通气是一种与临床应用类似的呼吸方式，动物的辅助通气一般可以通过设置压力触发、人工触发或定时触发等方式启动。对于动物呼吸机而言，辅助通气(AV）是一种较高级的呼吸模式，仅少量动物呼吸机具体此功能。

叹气模式(sigh): 是一种在常规呼吸通气条件下，隔一段时间进行一次深呼吸的通气方式。通常实验动物在长期使用控制通气，尤其是容量控制通气条件下，某些边缘肺泡会膨胀不全，肺部功能会逐步减弱，加入定时或手工叹气，可防止肺部萎陷不张，改善气体交换性能。

一、实验动物部分生理参数，作为动物生理参数实验监护的参考值：

二、气管插管

气管插管是为了在动物手术过程中保持动物呼吸道顺畅,减少动物窒息死亡的常用手术。

同时气管内插管还可用于气管内给药治疗研究。气管插管对犬、猪等大动物操作过程相对容易,对啮齿类动物相对较难，是动物呼吸机辅助呼吸的重要步骤。在某些需要呼吸机 辅助呼吸的实验中，顺利的气管插管是实验成败的关键之一。 气管插管推荐使用静脉留置针的套管:大鼠一般使用14-18G插管， 小鼠一般使用20-24G插管。

不同的实验室采用不同的插管技术，目前所使用的有：

1、切气管，直接插管法

2、切气管，逆行导丝法

3、 经口插管，盲插法

4、经口插管，透射光辅助法

5、经口插管，光纤辅助法

三、选择通气模式:选择压力控制模式或者容量控制模式。

采用压控模式相对安全，因为不会过度充胀动物的肺，也不会对“脆弱”的肺造成伤害；参数容易设置和操作，而不用管动物的肺的容积和柔韧度；然而，若实验时间很长（通常超过1小时，很有可能在动物的气道积聚分泌物或其它阻塞物，导致吸气提前终止（此时需疏通气管和气道）。

容控模式则适合长时间实验，因为它总是输送一定量体积的气体至动物的肺部，不会引起动物的肺的柔韧度变化；然而，参数的预设置相对复杂，需确定气体流量和吸气时间（或吸呼比），一旦这两个参数设定，若想对呼吸的状态随时进行调整就很容易，只需简单地升高或降低气体流量，这样，可精细地调节动物的呼吸以维持较恒定的CO2分压。

总之，压控模式设置快速、操作安全，适用于短时间的动物实验和呼吸机初级使用者；容控模式设置相对复杂，但可精细调节动物的呼吸，适合长时间的动物实验。

如选择容积控制模式，根据如下参考，选择相对应的动物的潮气量和呼吸频率。

呼吸未正压(PEEP):在呼气末气道开放时，气道压力仍保持高于大气压，防止肺泡萎缩塌陷，一般开胸手术需要设置PEEP，设置的范围是为3-125pxH2O。

吸/呼比（I/E Ratio)：吸气与呼气时间的比例，一般设置为1/2，某些活塞式呼吸机这个参数不可设置，相当于1/1。

呼吸机的设置就完成了，可以进行下一步实验操作了。